Рабочий объем двигателя - 5987 кубических сантиметров Количество цилиндров - V12 Общее количество клапанов - 48 Развал блока цилиндров - 60 градусов Диаметр цилиндра и ход поршня - 91.5 х 92.4 мм Степень сжатия - 10.5 : 1 Тип ДВС - атмосферный Количество лошадей с литра объема - 125 л.с./л
Максимальная мощность - 750 л.с. на 7500 об/мин Максимальный крутящий момент - 710 Н/м 5700 об/мин
Моторный отсек Pagani Zonda R выполнед достаточно просто. В нем нет каких либо особенных систем выпуска либо других необычных элементов конструкции. Зато впуск выполнен в стиле двигателей формула 1, что подчеркивает высокий класс данного автомобиля.